¿Cuál es el mejor software de facturación médica en 2026?
Un buen programa de facturación no se nota. Las facturas salen bien a la primera, y las mutuas pagan sin perseguirlas.
Facturas a pacientes privados, a tres aseguradoras con tarifas distintas y a una mutua que paga cuando quiere. Cada final de mes cuadras volantes en un Excel, y además tienes que cumplir Verifactu. Un software de facturación médica ordena todo eso: emite la factura legal, separa lo que paga cada compañía y te dice qué falta por cobrar.
La respuesta corta. Clinic Cloud es la mejor opción para la mayoría de consultas: desde 29 € al mes + IVA, con Verifactu desde el plan básico. Nubidoc es la mejor si trabajas mucho con mutuas: autorizaciones, volantes y liquidación mensual, por 44,90 € más 14,90 € sin IVA. NexusClinic lo incluye todo desde 19 € sin IVA. Nubimed es la mejor para liquidar a varios profesionales. ObeliOmed calcula los copagos por aseguradora.
Lo que casi nadie te dice: muchas listas de «software de facturación médica» son traducciones de rankings de Estados Unidos, pensadas para seguros americanos. Aquí solo clasificamos programas cuya web confirma a la vez las mutuas y Verifactu.
El ranking es editorial: una plaza patrocinada siempre se señala en su ficha, y ningún enlace de afiliado cambia una nota.
El mejor software de facturación según tu consulta
Verifactu desde 29 € + IVA
La mejor para mutuasAutorizaciones, volantes y liquidación
Todo incluido al menor precioDesde 19 € sin IVA
Liquidación de profesionalesMutuas y liquidación en PREMIUM
Baremos por aseguradoraCopagos calculados solos
Conexión con aseguradorasFuera del ranking, Verifactu sin confirmar
Los 5 programas de facturación médica comparados
El ranking se dirige a una consulta o clínica privada en España, de 1 a 10 profesionales, que factura a pacientes y a mutuas o aseguradoras. Cada programa clasificado publica su precio y menciona en su web oficial la gestión de mutuas y la facturación Verifactu. Los que no lo confirman tienen una ficha más abajo, sin nota.
| Mejor para | Lo que lo distingue | Plan gratis | Tamaño del equipo | Ver | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Clinic Cloud | La mejor opción global | Verifactu y TicketBAI desde Mini | 4.3/5 | 29 €/mes + IVA | — | 1 a 5 profesionales | Ver → |
| 2 | Nubidoc | La mejor para mutuas | Autorizaciones, volantes, liquidación | 4.2/5 | 44,90 € + 14,90 €/mes sin IVA | — | Clínicas con muchas mutuas | Ver → |
| 3 | NexusClinic | Todo incluido al menor precio | Verifactu y mutuas en todos los planes | 4.1/5 | 19 €/mes sin IVA | — | 1 a 3 profesionales | Ver → |
| 4 | Nubimed | Liquidación de profesionales | Informe de liquidación por profesional | 4.0/5 | 50,10 €/mes sin IVA (PREMIUM) | — | 2 a 10 profesionales | Ver → |
| 5 | ObeliOmed | Baremos por aseguradora | Copagos por aseguradora y acto | 3.9/5 | 29 €/mes por centro sin IVA + 15 € facturación | — | Centros con copagos | Ver → |
Notas sobre cinco criterios ponderados, detallados en el método. Precios tomados en 2026 de las webs oficiales de cada programa. Ninguno ofrece un plan gratis permanente para facturar.
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Cómo hemos comparado y puntuado
Esta página es para el profesional sanitario privado o el gerente de una clínica pequeña: fisioterapia, psicología, medicina, podología, nutrición. No cubre los grandes grupos hospitalarios, que compran con concurso y proyectos de meses.
Hemos aplicado dos filtros. El programa tiene que gestionar la facturación a mutuas o aseguradoras, porque en España es lo que separa un programa de clínica de un simple facturador. Y tiene que publicar su precio. Las listas traducidas de Estados Unidos (con seguros americanos y normas que aquí no existen) quedan fuera.
La ponderación sigue lo que cuesta dinero a una clínica. Mutuas y aseguradoras pesan un 30 %: tarifas por compañía, volantes, autorizaciones. La facturación legal pesa un 25 %: Verifactu en el territorio común, TicketBAI en el País Vasco. El precio real pesa un 20 %, calculado al año con las agendas que de verdad necesitas. La agenda y la historia clínica cuentan un 15 %, la facilidad y el soporte un 10 %.
Lo que más se repite al comparar: casi todos los programas dicen «mutuas», pero pocos explican cómo facturan a cada compañía. Pregúntalo siempre con un ejemplo real antes de pagar.
- Mutuas y aseguradorasTarifas por compañía, volantes, autorizaciones, conexión con aseguradoras.30 %
- Facturación legalVerifactu, TicketBAI, numeración y facturas rectificativas.25 %
- Precio realCoste anual con las agendas necesarias, IVA, permanencia y extras como SMS.20 %
- Agenda e historia clínicaAgenda por profesional, historia clínica, bonos, recordatorios.15 %
- Facilidad y soportePuesta en marcha, migración, formación y soporte.10 %
Ningún enlace de afiliado cambia una nota o un puesto.
Los precios y las normas de facturación cambian cada año. Recibe los cambios
Clinic Cloud
Clinic Cloud es un programa de gestión de clínicas en la nube: agenda, historia clínica, facturación, caja y bonos en la misma herramienta. Su módulo de facturación integra bonos, mutuas y cobros, y el plan más básico ya incluye la facturación electrónica con Verifactu y TicketBAI.
Los precios son públicos y claros. Mini cuesta 29 € al mes + IVA con 1 agenda, Pro 49 € con 3 agendas y Max 79 € con 5 agendas. Cada agenda extra suma 10 € hasta el límite del plan. No hay permanencia, ni coste de instalación, y la migración de datos y la formación son gratis.
Para una clínica de fisioterapia con dos profesionales, el cálculo sale así: Mini más una agenda extra, 39 € + IVA al mes, unos 468 € + IVA al año. Con tres profesionales, Pro a 49 € sale más a cuenta que Mini con dos agendas extra.
Su límite: la conexión directa con las compañías de seguros aparece en su web como «próximamente», con una integración prevista con SEOGA. Hoy puedes gestionar las mutuas y sus tarifas en la facturación, pero la autorización electrónica con la aseguradora todavía no está. Si trabajas sobre todo con volantes de Sanitas, Adeslas o DKV, pregúntalo antes.
Truco: empieza en Mini y sube de plan solo cuando necesites la tercera agenda. El salto de 29 € a 49 € compensa a partir de dos agendas extra.
- Verifactu y TicketBAI desde el plan Mini
- Sin permanencia ni coste de instalación
- Migración de datos gratis
- ✓Precios públicos y bajos
- ✓Pensado para la facturación española
- ✓Mutuas y bonos en la facturación
- ✗Conexión con aseguradoras aún «próximamente»
- ✗Agendas extra de pago
- ✗Mutuas sin detalle por plan
La primera opción para una clínica pequeña que quiere cumplir Verifactu y gestionar mutuas con un precio claro. Confirma el estado de la conexión con aseguradoras si dependes de ella.
Nubidoc
Nubidoc es el programa de este ranking que más lejos llega con las mutuas. Su módulo de gestión avanzada de mutuas cubre las autorizaciones y los volantes, las reglas de cobertura de cada compañía y la liquidación mensual, que se importa y se concilia de una sola vez. Es exactamente la tarea que se come la tarde del último día del mes en recepción.
La facturación va incluida en el plan base y emite facturas conformes a Verifactu y TicketBAI, con un modo de pruebas por cliente y por centro. Así puedes probar la cadena de facturas antes de emitir la primera de verdad.
El precio es público: 44,90 € al mes sin IVA para un profesional, 5,95 € por cada usuario más, y 14,90 € por el módulo de mutuas. Para dos profesionales con mutuas, salen 65,75 € al mes sin IVA, unos 789 € al año. No hay permanencia, y la prueba dura 15 días sin tarjeta.
Su límite: es el plan base más caro de los cinco, y la gestión de mutuas se paga aparte. Para una consulta que solo cobra a pacientes directos, no compensa. Los otros módulos (comisiones de profesionales, SEPA) también suman: 9,90 € cada uno.
Truco: importa la liquidación de la mutua el mismo día que llega y concíliala con el módulo. Los actos que la compañía no ha pagado aparecen solos, y puedes reclamarlos mientras el volante todavía es reciente.
- Autorizaciones, volantes y reglas de cobertura
- Liquidación mensual importada y conciliada
- Verifactu y TicketBAI con modo de pruebas
- ✓La gestión de mutuas más completa
- ✓Sin permanencia
- ✓Exporta todos tus datos al salir
- ✗Plan base más caro
- ✗Mutuas en módulo de pago
- ✗Los módulos suman rápido
La elección si las mutuas son una parte grande de tu facturación. Para una consulta solo privada, hay opciones más baratas.
NexusClinic
NexusClinic es un programa de gestión clínica para fisioterapia, podología, psicología y estética. Su argumento es sencillo: todas las funciones están en todos los planes, y solo cambian los profesionales y los avisos por WhatsApp incluidos. La facturación Verifactu con tu número de colegiado y los bonos, presupuestos, mutuas y cierre de caja están desde el plan más barato.
El plan Autónomo cuesta 19 € al mes sin IVA para un profesional, con 300 avisos de WhatsApp al mes. Clínica cuesta 29 € para hasta 3 profesionales, con 600 avisos. Centro cuesta 49 €, con 1.200 avisos. El IVA del 21 % se añade al cobrar: el plan Autónomo sale a 22,99 € al mes. No hay permanencia, y el pago anual rebaja un 17 %.
Al año, un profesional paga 228 € sin IVA con todo incluido. Es el precio más bajo de este ranking para tener a la vez Verifactu y mutuas.
Su límite: la propia web se contradice sobre el plan Centro (profesionales ilimitados en un sitio, 5 en la tabla comparativa). Pide el límite por escrito. La web tampoco detalla cómo se factura a cada aseguradora, más allá de la mención de mutuas.
Truco: los avisos por WhatsApp incluidos reducen las ausencias. Antes de pagar un plan superior, comprueba si el cupo de tu plan te basta.
- Verifactu con número de colegiado en todos los planes
- Mutuas y bonos desde 19 €
- Avisos por WhatsApp incluidos
- ✓El todo incluido más barato
- ✓Sin permanencia
- ✓Descuento anual del 17 %
- ✗Contradicción sobre el límite del plan Centro
- ✗Facturación a aseguradoras poco detallada
- ✗Pensado para consultas, no hospitales
La mejor relación precio y funciones para un profesional que empieza o una consulta pequeña. Confirma el límite de profesionales antes de crecer.
Nubimed
Nubimed es un programa de gestión clínica en la nube con dos planes públicos. LITE cuesta 27,40 € al mes sin IVA con un usuario con agenda, y cada agenda adicional suma 2,40 €. PREMIUM cuesta 50,10 € con una agenda, y cada agenda más 5,10 €. Recepción, administración, gestores y contables son usuarios ilimitados y gratis en los dos planes.
Lo que pesa para esta página está en PREMIUM: la gestión de mutuas, la contabilidad y facturación con TicketBAI y Verifactu, y un informe de liquidación de profesionales. Ese informe resuelve el dolor de cabeza de fin de mes en un centro donde cada fisioterapeuta o médico cobra un porcentaje de lo facturado.
Haz la cuenta para cuatro profesionales en PREMIUM: 50,10 € + 3 × 5,10 € = 65,40 € al mes sin IVA, unos 785 € al año. Es poco para un centro de ese tamaño. No hay cuota de entrada ni permanencia.
Su límite: LITE no incluye ni mutuas ni Verifactu, así que para facturar de forma legal en 2026 el plan real es PREMIUM. La web no detalla cómo se factura a cada aseguradora: pregunta si genera la factura por compañía con sus tarifas. Los SMS de recordatorio cuestan 0,08 € + IVA cada uno.
Truco: da de alta a recepción y a tu gestoría como usuarios sin agenda. No pagan, y tu gestor consulta la facturación sin pedirte un Excel.
- Gestión de mutuas en PREMIUM
- Informe de liquidación de profesionales
- Usuarios sin agenda gratis e ilimitados
- ✓Precio por agenda muy bajo
- ✓Verifactu y TicketBAI en PREMIUM
- ✓Sin cuota de entrada ni permanencia
- ✗LITE sin mutuas ni Verifactu
- ✗Facturación a aseguradoras poco detallada
- ✗SMS de pago
La mejor relación precio y funciones para un centro con varios profesionales. Ve directo a PREMIUM.
ObeliOmed
ObeliOmed trata la facturación médica como un problema de baremos. Defines una vez el precio de cada acto para cada aseguradora, y el reparto entre mutua y paciente (el copago) se calcula solo. Verifactu va de serie: cada factura y cada abono generan un registro encadenado con su huella, de modo que cualquier alteración rompe la cadena y se detecta.
Los planes son por centro y sin IVA. LITE cuesta 29 € al mes, PLUS 49 € con agenda y tratamientos, ENTERPRISE 79 € con recordatorios, plantillas, consentimientos y la facturación incluida. En LITE y PLUS, la facturación se añade por 15 € al mes. No hay coste de alta ni permanencia, y si te comprometes 12 meses pagas 10.
Haz la cuenta para una consulta con agenda y facturación: PLUS más el módulo, 64 € al mes sin IVA, 768 € al año. ENTERPRISE, a 79 €, solo compensa si usas sus recordatorios y consentimientos.
Su límite: los usuarios extra son caros (25 € por especialista, 10 € por administrativo). Para una clínica con cinco profesionales, la factura sube rápido frente a NexusClinic o Nubimed.
Truco: si sabes que te quedas el año, paga los 12 meses por adelantado. Te ahorras dos cuotas en el plan, los usuarios y los módulos.
- Baremos por aseguradora y tipo de acto
- Reparto mutua y paciente automático
- Verifactu encadenado de serie
- ✓Copagos calculados solos
- ✓Sin permanencia ni alta
- ✓12 meses por el precio de 10
- ✗Facturación de pago fuera de ENTERPRISE
- ✗Usuarios extra caros
- ✗Precio por centro que sube con el equipo
Un buen encaje para un centro con muchos copagos. Calcula el coste con tu equipo real antes de elegir plan.
Cuánto cuesta de verdad un programa de facturación al año
Unos precios llevan IVA y otros no, unos cobran por agenda, otros por centro o por módulo. Este es el coste anual aproximado con los precios oficiales, sin IVA, en el plan que incluye mutuas y Verifactu.
Un profesional
NexusClinic Autónomo: 228 € al año. Clinic Cloud Mini: 348 €. Nubimed PREMIUM: 601 €. Nubidoc con el módulo de mutuas: 717 €. ObeliOmed LITE con facturación: 528 €. Para un solo profesional, NexusClinic es el más barato con todo incluido.
Tres profesionales
NexusClinic Clínica: 348 € al año. Clinic Cloud Pro, con 3 agendas: 588 €. Nubimed PREMIUM con 2 agendas más: 724 €. Nubidoc con 2 usuarios más y mutuas: 860 €. La diferencia se paga en profundidad de gestión de mutuas.
Lo que se suma
Los SMS (0,08 € cada uno en Nubimed), las agendas extra (10 € en Clinic Cloud), los usuarios extra (25 € por especialista en ObeliOmed) y el IVA del 21 %. Ninguno de los cinco anuncia permanencia, pero pide siempre las condiciones por escrito.
- ¿El programa factura a cada aseguradora con sus propias tarifas?
- ¿Cumple Verifactu, o TicketBAI si estás en el País Vasco?
- ¿Los precios llevan IVA?
- ¿Cuántas agendas incluye el plan y cuánto cuesta cada una más?
- ¿Hay permanencia o cuota de entrada?
- ¿Puedes exportar pacientes y facturas si cambias de programa?
Otras herramientas que aparecen en las búsquedas
Estas herramientas salen a menudo cuando buscas un programa de facturación médica. No las clasificamos porque su web no confirma Verifactu o no factura a mutuas. Esto es lo que debes saber.
Ofimedic: la conexión con aseguradoras, sin Verifactu confirmado
AseguradorasOfimedic reúne compañías de seguros y facturación, y tramita operaciones con las aseguradoras mediante SEOGA, que además te dice cuánto pagará la compañía. Ofimedic Cloud empieza en 15 € al mes y Net Local en 31 €, sin IVA precisado. Su web no menciona Verifactu: pídelo por escrito antes de contratar. Por eso no está clasificado.
- Precio
- Desde 15 €/mes, IVA no precisado
- A pedir
- Confirmación de Verifactu
Clinni: el precio más bajo, sin Verifactu confirmado
BaratoClinni cuesta 12,95 € al mes + impuestos, con un mes gratis. Trabaja con pacientes directos y aseguradoras, con bonos y volantes, y se integra con TicketBAI para el País Vasco. Su página de precios no menciona Verifactu, que es la norma en el resto de España: confírmalo antes de pagar.
- Precio
- 12,95 €/mes + impuestos
- Norma
- TicketBAI sí, Verifactu sin confirmar
Doctoralia: agenda y pacientes nuevos
CaptaciónDoctoralia vende planes Starter a 89 €, Plus a 109 € y VIP a 129 € al mes + IVA, facturados al año. Sirven para la agenda online y para atraer pacientes. Su página de precios no habla de facturación a mutuas ni de Verifactu: combínalo con un programa de esta lista.
- Precio
- 89 a 129 €/mes + IVA, anual
- Para qué
- Agenda y visibilidad
Los errores que más cuestan a una clínica
Los problemas casi nunca vienen de la factura en sí. Vienen del plan elegido, de las mutuas y de la norma.
Elegir el plan barato sin mutuas
PlanEn Nubimed, la gestión de mutuas y Verifactu solo están en PREMIUM. En Nubidoc, la gestión avanzada de mutuas es un módulo de 14,90 €. Mira siempre en qué plan está la función que necesitas antes de comparar precios.
- Ejemplos
- Nubimed LITE, Nubidoc sin módulo
- Solución
- Comparar el plan completo
No confirmar Verifactu por escrito
NormaLos cinco programas clasificados lo mencionan en su web. Ofimedic y Clinni no. Si trabajas fuera del País Vasco, pide al proveedor la confirmación de Verifactu por escrito antes de contratar.
- En la web
- Los 5 clasificados
- A pedir
- Ofimedic, Clinni
Confundir «gestión de mutuas» con conexión a la aseguradora
FuncionesGestionar mutuas suele significar tarifas por compañía y facturas separadas. Conectarse con la aseguradora (como SEOGA en Ofimedic) es otra cosa: autoriza el acto y te dice cuánto pagará. Clinic Cloud lo anuncia como «próximamente».
- Conexión hoy
- Ofimedic con SEOGA
- Próximamente
- Clinic Cloud
Comparar precios con y sin IVA
PrecioClinic Cloud muestra sus precios + IVA. Nubimed, Nubidoc, NexusClinic y ObeliOmed los muestran sin IVA. Pasa todos los precios a la misma base antes de compararlos: un 21 % cambia el orden.
- + IVA
- Clinic Cloud
- Sin IVA
- Nubimed, Nubidoc, NexusClinic, ObeliOmed
Cobrar antes a pacientes y mutuas
La mayoría de los retrasos de cobro se evitan antes de facturar. Estos hábitos se repiten en las clínicas con menos pendientes.
Carga las tarifas de cada aseguradora
Antes de la primera factura, introduce las tarifas de cada compañía con la que trabajas. Así el programa factura el importe correcto a cada una, y no descubres la diferencia cuando llega el pago.
Registra el volante en la cita
Pide y registra el volante o la autorización el mismo día de la cita. Un acto sin volante es un acto que la mutua no paga, y reclamarlo un mes después casi nunca funciona.
Cierra la liquidación cada mes
Si cada profesional cobra un porcentaje, cierra la liquidación el último día del mes con el informe del programa. Nubimed lo trae en PREMIUM. Evitas discusiones y errores de Excel.
Haz una factura de prueba a una mutua
Usa el periodo de prueba (15 días en Nubidoc) para emitir una factura real a una compañía. Si el formato no le sirve, lo sabrás antes de pagar.
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Para ir más lejos
Estas páginas completan esta, en facturación y cobros.
Tus preguntas sobre el software de facturación médica
¿Qué hace un software de facturación médica?
Emite las facturas legales de tu consulta, separa lo que paga el paciente de lo que paga cada mutua o aseguradora, y te muestra lo pendiente de cobro. Los mejores añaden agenda, historia clínica y liquidación de profesionales.
¿Cuánto cuesta un programa de facturación para clínicas?
Entre 19 € y 79 € al mes sin IVA en los programas de este ranking, según los profesionales y los módulos. Para un profesional con mutuas y Verifactu, desde 228 € al año sin IVA con NexusClinic.
¿Tengo que cumplir Verifactu en mi consulta?
Si facturas en territorio común con un programa informático, tu programa debe adaptarse a Verifactu. En el País Vasco se aplica TicketBAI. Pide siempre la confirmación por escrito al proveedor.
¿Cómo se factura a una mutua o aseguradora?
Cada compañía tiene sus tarifas y su forma de recibir la factura, normalmente con el volante o la autorización del acto. El programa debe guardar las tarifas por compañía y agrupar los actos para emitir la factura periódica.
¿Qué es SEOGA?
Es la conexión que usa Ofimedic para tramitar operaciones con las aseguradoras de forma automática y ver cuánto pagarán. Clinic Cloud anuncia una integración con SEOGA como próxima.
¿Existe un programa de facturación médica gratis?
No entre los clasificados. Nubidoc ofrece 15 días gratis y Clinic Cloud una prueba sin tarjeta. Para facturar a mutuas y cumplir la norma, cuenta con una cuota mensual.
¿Sirve Doctoralia para facturar?
Doctoralia sirve para la agenda online y para atraer pacientes, desde 89 € al mes + IVA. Su página de precios no incluye facturación a mutuas: combínalo con un programa de este ranking.