Quel logiciel de comptabilité choisir quand on est indépendant en 2026 ?

Indy est le seul logiciel du classement qui te suit quand ton régime change. En micro, la formule Autonomie à 15 € HT par mois à l'année envoie ta déclaration de chiffre d'affaires à l'Urssaf et remplit ton livre des recettes. Le jour où tu passes à la déclaration contrôlée, tu restes chez Indy : en EI au régime BNC, Autonomie passe à 22 € HT par mois à l'année et produit ta 2035, la télétransmet aux impôts, et gère la TVA, la CFE, la DAS2 et la 2042-C-PRO.

Sur un an au réel BNC, ça fait 264 € HT en annuel, ou 336 € HT au mois (12 × 28 €). Pour comparer, un cabinet en ligne spécialisé démarre à 39 € HT par mois, soit 468 € par an, avec un humain qui fait la 2035 à ta place. Indy te laisse la main : c'est toi qui valides la catégorisation de chaque dépense, et c'est toi qui réponds si les impôts posent une question. La formule Sérénité, dès 71 € HT par mois, ajoute un expert-comptable partenaire qui certifie ton bilan.

La limite à connaître avant de signer : Indy accepte l'EI au réel en BNC, pas en BIC. Un artisan ou un consultant classé en BIC qui sort de la micro doit regarder ailleurs, ou passer en société à l'IS (Autonomie à 49 € HT par mois). Les avis saluent la prise en main ; les reproches portent sur le support, joignable par chat et e-mail seulement, sans téléphone.

Astuce : avant de quitter la micro, connecte ta banque sur la formule gratuite et laisse Indy catégoriser trois mois de dépenses. Tu verras si tes charges dépassent 34 % de tes recettes, le seuil où le réel devient plus intéressant en BNC.

Pennylane est l'outil le plus complet du classement, et le plus cher dès qu'on parle de comptabilité. Sa grille pour indépendants a quatre paliers, tous pour un seul utilisateur. Starter, à 7 € HT par mois, couvre la facturation et la synchronisation bancaire, mais impose d'ouvrir le compte pro Pennylane. Basique (14 €) et Essentiel (24 €) ajoutent les acomptes, les relances automatiques, les factures récurrentes, les notes de frais et un prévisionnel de trésorerie.

La comptabilité arrive seulement avec Premium, à 79 € HT par mois, soit 948 € HT par an. Pour ce prix, tu as la saisie automatisée, les rapports comptables, les clôtures mensuelles et annuelles, et l'envoi des déclarations fiscales en EDI (TVA, liasse fiscale). C'est ce qui le rend utile à un indépendant au réel BIC, que le classement couvre mal ailleurs. La grille ne nomme pas la 2035 : si tu es libéral, fais-toi confirmer le formulaire pendant les 15 jours d'essai.

Pennylane figure sur la liste officielle des plateformes agréées. Les avis saluent un support humain qui comprend la comptabilité. Ils reprochent un assistant virtuel qui passe avant l'humain, et des connecteurs encore incomplets.

Astuce : si ton expert-comptable travaille déjà sur Pennylane, reste sur Essentiel à 24 € et laisse-le faire la liasse depuis son propre accès. Tu évites de payer Premium pour un module que ton cabinet utilise déjà.

Freebe vend une seule formule, au même prix pour tous les statuts : 150 € TTC par an, sans engagement. Micro, EI, SASU ou EURL, tu as les mêmes fonctions : devis et factures illimités, synchronisation avec plus de 450 banques, livre des recettes et registre des achats, suivi du temps, paiement en ligne par carte ou virement sans commission.

En micro, la déclaration Urssaf est pré-remplie : Freebe calcule ton chiffre d'affaires encaissé et tes cotisations, tu valides. C'est sa force pour un freelance. Au réel, en revanche, Freebe reste un outil de facturation et de pré-comptabilité : sa page ne parle ni de 2035, ni de bilan. Il te faudra un expert-comptable, ou exporter tes données vers un outil qui produit la déclaration.

Pour la facture électronique, Freebe n'est pas lui-même plateforme agréée et passe par un partenaire agréé. C'est un montage autorisé. Les avis sont très bons mais peu nombreux (moins de trente) : trop peu pour juger le support sur la durée.

Astuce : si tu factures au temps passé, lance le chronomètre de Freebe sur chaque mission pendant l'essai de 30 jours. Le passage du temps suivi à la facture se fait en deux clics, et c'est là que l'outil se distingue.

Tiime n'essaie pas de remplacer ton comptable : il lui prépare le travail. La formule Free, à 0 €, couvre la facture électronique par la plateforme agréée de Tiime, les devis et factures illimités, le livre des recettes et les relances. Ton expert-comptable a accès gratuitement à tes données de facturation électronique.

Smart, à 17,99 € HT par mois (215,88 € par an), ajoute la synchronisation bancaire illimitée, la catégorisation automatique des transactions, les notes de frais et une collaboration complète avec le cabinet. Business, à 24,99 €, vise les structures qui grandissent. Aucune formule ne produit seule ta 2035, ton bilan ou tes déclarations Urssaf : c'est le cabinet qui s'en charge.

D'où son rang. Pour un libéral au réel qui paie déjà un comptable, Tiime Free est le meilleur gratuit du classement, et l'essai de 60 jours sur Smart laisse le temps de juger. Pour un indépendant qui veut tout faire seul, il ne suffit pas. Les avis saluent une interface intuitive et la photo des justificatifs ; ils reprochent des réponses lentes sur les problèmes techniques.

Astuce : demande à ton cabinet s'il travaille déjà avec Tiime. Plusieurs cabinets en ligne l'utilisent comme application client, et ton abonnement Smart peut alors faire doublon.

Abby est le meilleur point de départ gratuit pour un indépendant en micro. La formule Basique, à 0 €, contient la facture électronique, les devis et factures illimités, le livre des recettes et le registre des achats, l'estimation de tes cotisations Urssaf et des alertes quand tu approches des seuils de TVA.

Start, à 9 € HT par mois, ajoute la déclaration Urssaf. Pro, à 15 €, branche ton compte bancaire et relance les impayés. Business, à 33 €, ajoute la déclaration d'impôts et plusieurs utilisateurs. Abby annonce jusqu'à 20 % de moins à l'année, sans afficher le montant exact.

Sa limite pour cette page est nette : la grille ne parle ni de 2035, ni de bilan. Abby est fait pour la micro. Si tu prévois de passer au réel dans un ou deux ans, tu changeras d'outil à ce moment-là, avec un export à faire. Les avis saluent la simplicité ; ils reprochent une inscription qui démarre sur l'essai payant, alors que la version gratuite reste disponible à la fin de l'essai.

Astuce : à la fin des 14 jours, choisis explicitement Basique. Rien n'est prélevé, et tu gardes ton livre des recettes et la facture électronique.

Superindep vise deux publics précis : les micro-entrepreneurs et les artistes-auteurs. Ces derniers sont rarement servis par les autres logiciels, et c'est la vraie raison de sa place ici. La facturation est gratuite ; dès Basique, à 19 € HT par mois ou 16,58 € à l'année, ta déclaration Urssaf part automatiquement et ton livre des recettes est tenu.

Sur un an, Basique coûte 198,96 € HT en annuel. C'est plus cher qu'Indy pour le même socle, et une déclaration erronée à corriger te coûte 39 € HT en Basique. Sérénité, à 39 € HT par mois, automatise la TVA et inclut ces corrections. Maître Zen, à 99 €, ajoute un expert-comptable.

Pas de 2035 sur la grille : Superindep ne te suivra pas au réel. Les avis sont presque tous à cinq étoiles et parlent de l'équipe ; la critique visible porte sur l'absence d'application mobile.

Astuce : si tu es artiste-auteur avec une petite activité en micro à côté, Superindep est l'un des rares services à gérer les deux.