¿Cuál es el mejor software de nóminas para una pyme en 2026?
La pregunta no es solo qué programa usar, sino quién hace la nómina: tú, un programa con soporte o tu gestoría.
Un software de nóminas calcula el bruto y el neto, la retención de IRPF y las cotizaciones, genera el recibo de salarios y prepara los ficheros para la Seguridad Social. En una pyme de tres o cuatro empleados, eso lo suele hacer la gestoría. Pasarlo a un programa propio puede ahorrar dinero, siempre que alguien de la empresa sepa leer su convenio colectivo.
La respuesta corta: elige PayFit si quieres un programa completo con precio publicado y un equipo que te acompaña. Elige Holded si ya llevas tu facturación y contabilidad ahí: su módulo de nóminas cuesta 5 € por empleado al mes. Factorial encaja si buscas sobre todo control horario y RR. HH. Nominasol y miNomina son programas clásicos, más pensados para quien ya sabe de nóminas.
Antes de decidir, lee la parte del coste real: con pocos empleados, la cuota fija pesa más que el precio por persona, y ningún programa te libra de revisar el convenio.
La clasificación es editorial: una posición patrocinada siempre se indica en su ficha, y ningún enlace de afiliado cambia una nota.
El mejor software de nóminas según tu situación
Los 5 programas de nóminas para pymes comparados
La clasificación completa. Los precios son sin IVA, leídos en las páginas oficiales de cada editor en 2026. Ojo con las unidades: unos cobran una cuota fija más un precio por empleado, otros venden módulos sueltos y otros solo dan precio tras una llamada.
| Mejor para | Lo que mejor hace | Plan gratis | Tamaño del equipo | Ver | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | PayFit | Mejor programa completo | Precio publicado y equipo que acompaña la puesta en marcha | 4.4/5 | Cuota base 49 € + 16 €/empleado al mes | — | Pyme de 1 a 24 empleados | Ver → |
| 2 | Holded | Mejor si ya usas Holded | Nóminas, contabilidad y remesas en el mismo programa | 4.0/5 | Módulo Nóminas 5 €/empleado al mes, sobre un plan de Holded | — | Autónomo con empleados, pequeña pyme | Ver → |
| 3 | Factorial | Mejor para RR. HH. y control horario | Fichajes y ausencias conectados con la nómina | 3.9/5 | RR. HH. desde 5 €/persona al mes; nómina con presupuesto a medida | — | Pyme que necesita registro de jornada | Ver → |
| 4 | TeamSystem Nominasol | Mejor programa clásico | Programa veterano con prueba de 30 días | 3.8/5 | Valoración personalizada; prueba gratis de 30 días | — | Pyme con alguien que ya sabe de nóminas | Ver → |
| 5 | miNomina | Mejor para delegar en un especialista | Editor centrado solo en nóminas | 3.6/5 | Precio a consultar con el editor | — | Pyme que quiere un especialista en nóminas | Ver → |
Ninguno de estos programas tiene aún una reseña en Labs: las notas salen de nuestra comparación y los precios de las páginas oficiales de los editores, en 2026.
Cómo hemos comparado y puntuado
Los comparativos mejor posicionados en Google los firman casi siempre los propios editores. Ninguno calcula lo que paga una pyme de tres empleados, y casi ninguno recuerda que la nómina no termina en el programa: las cotizaciones siguen saliendo hacia la Seguridad Social por el Sistema RED, con SILTRA.
Hemos leído las tarifas oficiales, las condiciones de cada plan, la documentación de ayuda de los editores y muchas opiniones de usuarios, sobre todo las negativas. a3innuva y Sage no aparecen clasificados: no pudimos leer su precio en una página oficial. Sesame exige un mínimo de 15 empleados y vende la nómina aparte, y Endalia apunta a empresas más grandes.
- Facilidad de usoSacar una nómina correcta sin ser graduado social.20 %
- Relación calidad-precioCoste real con 1, 3 y 9 empleados, cuotas fijas y módulos. Es la primera fuente de sorpresas.25 %
- Funciones y cumplimientoConvenio colectivo, IRPF, cotizaciones, ficheros para la Seguridad Social. Una nómina mal hecha cuesta más que cualquier suscripción.30 %
- Soporte y acompañamientoAlguien que responde el día del cierre, no solo en la demo.15 %
- IntegracionesContabilidad, banco, control horario. Útil, pero secundario a este tamaño.10 %
Ningún enlace de afiliado cambia una nota ni una posición.
PayFit
PayFit encabeza la clasificación por algo poco habitual en este mercado: publica sus precios. El plan Estándar cuesta 16 € por empleado al mes más una cuota base fija. Esa cuota es de 49 € de 1 a 3 empleados, 59 € de 4 a 9 y 69 € de 10 a 24. Los planes Avanzado y Premium suben a 19 € y 22 € por empleado. Cada centro de trabajo adicional suma 29 €.
Con un empleado pagas 65 € al mes. Con tres, 97 €. A cambio, el programa calcula las nóminas, la retención de IRPF y las cotizaciones, y un equipo te acompaña en la puesta en marcha. Para una pyme que paga hoy a su gestoría por cada nómina, la comparación merece la pena.
Su límite es el precio con muy pocos empleados: la cuota base pesa mucho con uno o dos. Y como en todos los programas, el convenio colectivo debe estar bien configurado desde el primer mes. Un error ahí se repite en cada nómina hasta que alguien lo detecta.
Consejo: si estás cerca de un salto de tramo, como pasar de 3 a 4 empleados, calcula las dos cuotas antes de contratar. La base fija sube 10 € de golpe.
- Precios publicados y por tramos
- Equipo que acompaña la puesta en marcha
- Planes por empleado de 16 a 22 €
- ✓Precio claro antes de hablar con ventas
- ✓Muy completo para una pyme
- ✓Buena alternativa a pagar por nómina
- ✗Caro con uno o dos empleados
- ✗Cuota base que sube por tramos
- ✗Convenio a revisar desde el principio
La mejor opción si quieres sacar las nóminas de la gestoría con un programa serio. Si ya usas Holded para facturar, su módulo sale bastante más barato.
Holded
Holded es un programa de gestión español, conocido por la facturación y la contabilidad. Las nóminas llegan como un módulo aparte, una «gema» de su tienda, a 5 € por empleado al mes sobre tu plan de Holded. Calcula el bruto, el neto, el IRPF y las cotizaciones, genera los borradores de nómina para revisar y aprobar, y crea el asiento contable al aprobarlas.
Lo práctico está en lo que viene después. Holded prepara la remesa SEPA para pagar a tu equipo desde el banco y genera el fichero CRA, la relación nominal de trabajadores con sus cotizaciones, listo para importar en SILTRA. El envío al Sistema RED se sigue haciendo desde SILTRA: Holded te prepara el fichero, no lo presenta por ti.
Su límite es que no es un especialista en nóminas. Para convenios complejos, con muchos pluses o turnos, un programa dedicado o una gestoría siguen siendo más seguros. La implementación asistida, si la necesitas, se cobra aparte, desde 99 €.
Consejo: activa el módulo solo cuando tengas el convenio claro y el primer empleado dado de alta. Pagarás por empleado desde ese momento, no antes.
- Nóminas a 5 € por empleado
- Fichero CRA listo para SILTRA
- Remesa SEPA y asiento contable automáticos
- ✓Muy barato si ya pagas Holded
- ✓Nómina, banco y contabilidad juntos
- ✓Menos dobles registros
- ✗Necesita un plan de pago de Holded
- ✗Envío a la Seguridad Social desde SILTRA
- ✗Poco pensado para convenios complejos
La opción más económica si tu empresa ya vive en Holded. Si no lo usas, PayFit es más completo para empezar.
Factorial
Factorial es ante todo un programa de recursos humanos, y ahí sigue estando su fuerza: control horario, vacaciones, ausencias, documentos y firma de los empleados. Su web indica planes desde unos 5 € por persona al mes, con presupuesto a medida según lo que contrates.
La nómina es un producto aparte, «Asesoría digital y cálculo de nómina», que se añade a tu plan. Su precio no está publicado y se calcula en el presupuesto. La idea es que los fichajes y las ausencias del mes alimenten directamente el cálculo, sin que nadie copie datos a mano.
Su límite es la claridad del precio. No sabrás lo que pagas por las nóminas hasta hablar con ventas, y la suma de módulos puede crecer rápido. Para una pyme de dos empleados que no necesita control horario avanzado, es más herramienta de la que hace falta.
Consejo: pide el presupuesto separando RR. HH. y nómina. Así puedes comparar la parte de nómina con PayFit o con lo que cobra tu gestoría.
- Registro de jornada y ausencias
- Nómina conectada a los fichajes
- Módulos a elegir
- ✓Muy fuerte en RR. HH.
- ✓Menos datos copiados a mano
- ✓Interfaz agradable para los empleados
- ✗Precio de nómina solo con presupuesto
- ✗Los módulos se acumulan
- ✗Excesivo para una plantilla mínima
Una buena opción si tu primer problema es el registro de jornada. Si solo necesitas nóminas, PayFit u Holded son más directos.
TeamSystem Nominasol
Nominasol es uno de los programas de nóminas veteranos del mercado español, hoy en manos del grupo TeamSystem. Está pensado para quien conoce el oficio: muchas opciones de configuración, convenios, contratos y la gestión diaria de altas y bajas.
El editor no publica precios y propone una valoración personalizada, por teléfono o con su formulario de contacto. A favor, ofrece una prueba gratis de 30 días, sin compromiso y sin datos de pago, algo raro en este tipo de programa.
Su límite es la curva de aprendizaje. Para un gerente que nunca ha hecho una nómina, la cantidad de pantallas y opciones abruma, y el soporte da por hecho conocimientos básicos. Además, sin precio publicado, la comparación empieza a ciegas.
Consejo: usa los 30 días de prueba para rehacer una nómina real del mes anterior y compararla con la de tu gestoría, céntimo a céntimo.
- Prueba gratis de 30 días
- Programa veterano y muy completo
- Pensado para quien sabe de nóminas
- ✓Muy configurable
- ✓Prueba sin datos de pago
- ✓Respaldo de un grupo grande
- ✗Sin precio publicado
- ✗Curva de aprendizaje alta
- ✗Poco apto para un gerente novato
Bueno si en tu equipo alguien ya domina las nóminas. Si empiezas desde cero, PayFit te acompaña mejor.
miNomina
miNomina es un editor español centrado únicamente en nóminas. Presume de haber gestionado casi un millón de nóminas con sus programas y ofrece automatizar la subida de los recibos a la plataforma de los empleados.
No publica precio: hay que contactar por teléfono o con su formulario. Es el perfil típico de proveedor cercano, que trabaja con pequeñas empresas y asesorías, más que de plataforma que se contrata en dos clics.
Su límite es la falta de información pública. Ni precio, ni detalle de su envío a la Seguridad Social en la web. Para incluirlo en tu comparación, tendrás que pedir esos datos por escrito antes de decidir.
Consejo: pregunta cómo se generan los ficheros para SILTRA y quién los envía. Es la pregunta que separa un programa útil de uno que te deja medio trabajo.
- Editor centrado solo en nóminas
- Casi un millón de nóminas gestionadas
- Trato directo con el editor
- ✓Proveedor especializado
- ✓Cercano a las pymes
- ✓Automatiza la entrega de recibos
- ✗Sin precio público
- ✗Poca información en su web
- ✗Comparación difícil sin llamar
Una opción a considerar si prefieres un especialista cercano. Pide precio y proceso por escrito antes de comparar.
Lo que cuestan tus nóminas de verdad, y lo que cuesta un error
Los comparativos dan un precio de partida. Una pyme paga otra cosa: una cuota fija, un precio por empleado, módulos y, sobre todo, el tiempo de quien revisa. Estas son las cuentas con las tarifas oficiales, sin IVA y al mes.
Con un empleado
Con tres empleados
Con nueve empleados
- Comprueba que el programa conoce tu convenio colectivo y quién lo actualiza.
- Pregunta cómo se generan los ficheros para SILTRA y quién los envía al Sistema RED.
- Compara a la misma plantilla: cuota fija, precio por empleado y módulos no se leen igual.
- Recuerda que la empresa sigue siendo responsable de sus cotizaciones aunque use un programa.
- Pide por escrito el coste de implantación y de cada centro de trabajo adicional.
- Cambia de sistema a principio de año para no arrastrar acumulados de IRPF a mitad de ejercicio.
Pasar las nóminas de la gestoría a un programa sin sustos
Los comparativos no lo cuentan, y es donde una pyme se equivoca. Pasar de la gestoría a un programa propio a mitad de año, sin los acumulados, deja mal calculado el IRPF y complica el certificado de retenciones. Estos seis pasos lo evitan.
Elige bien el momento
AntesEl 1 de enero es la fecha más limpia: los acumulados del año empiezan de cero. Si cambias a mitad de año, el nuevo programa necesita lo cobrado y retenido por cada empleado desde enero, para que la retención de IRPF siga siendo correcta.
- Ideal
- Inicio del año natural
Pide a la gestoría todo el historial
AntesSolicita las nóminas, los contratos, los acumulados por empleado, los últimos ficheros de cotización y los modelos de retenciones presentados. Hazlo antes de comunicar el cambio: es más fácil recibirlo todo mientras la relación sigue activa.
- Pide
- Nóminas, contratos y acumulados
Configura el convenio con calma
TrampaEl convenio colectivo fija salarios mínimos, pluses, antigüedad y pagas extra. Es la parte que más errores provoca al pasar a un programa. Revisa las tablas salariales del año y compara la primera nómina con la de la gestoría, concepto por concepto.
- Revisa
- Tablas salariales del año
Organiza el envío por SILTRA
Seguridad SocialLas cotizaciones se presentan a la Seguridad Social por el Sistema RED, con SILTRA. Decide quién lo hace: tú, con una autorización RED propia, o un profesional autorizado. Programas como Holded preparan el fichero para importarlo en SILTRA, pero no lo envían por ti.
- Canal
- Sistema RED con SILTRA
Haz un mes en paralelo
ControlEl primer mes, deja que la gestoría haga las nóminas y calcúlalas también en el programa. Compara los netos línea por línea. Una diferencia de pocos euros casi siempre revela un plus del convenio o un tipo de retención mal configurado.
- Duración
- Un mes de nóminas
Revisa el primer pago
DespuésCuando pagues la primera nómina desde el programa, comprueba que la remesa bancaria coincide con los netos validados y avisa a tu equipo del cambio. Un empleado que cobra tarde por un error de remesa recuerda ese mes mucho tiempo.
- Vigila
- Primera remesa bancaria
Nóminas resueltas, lo siguiente
Estas páginas te ayudan con las otras herramientas de una pyme que contrata.
Contratos y anexos firmados a distancia.
Facturas desde tu CRMCRM con facturaciónPresupuestos y facturas sin doble registro.
Eres autónomo y aún sin empleadosLas herramientas del autónomoLo que necesitas antes de contratar.
Tu contabilidad va en Sage 50Cambiar de Sage 50Alternativas y migración.
Holded se te queda cortoCambiar de HoldedA qué programa pasar y cómo.
Tienes que cumplir con VeriFactuProgramas de facturación VeriFactuLos que cumplen y lo que cuestan.
Lo que más nos preguntan sobre nóminas en una pyme
¿Cuál es el mejor programa de nóminas para una pyme pequeña?
PayFit, si quieres un programa completo con precio publicado: 65 € al mes con un empleado en el plan Estándar. Si ya usas Holded para facturar, su módulo de nóminas a 5 € por empleado sale más barato. Con convenios complejos y nadie que sepa de nóminas, la gestoría sigue siendo una opción seria.
¿Hay algún programa de nóminas gratis?
No uno completo y fiable para empresas. Lo más cercano es la prueba gratis de 30 días de Nominasol, sin datos de pago. Úsala para rehacer una nómina real del mes anterior y comparar el resultado con tu gestoría antes de pagar nada.
¿Me sale más barato un programa o una gestoría?
Depende del tiempo que tengas. Un programa como PayFit cuesta 97 € al mes con tres empleados, pero alguien de tu empresa tiene que revisar cada mes las incidencias. Si nadie tiene ese tiempo o tu convenio es complejo, la gestoría compensa. Pide a la tuya el precio por nómina para comparar.
¿Puedo hacer yo mismo las nóminas de mis empleados?
Sí, ninguna norma lo impide. Pero necesitas conocer tu convenio colectivo, calcular bien el IRPF y las cotizaciones, y presentar los seguros sociales por el Sistema RED. Un programa hace los cálculos; la revisión y la responsabilidad siguen siendo tuyas.
¿Los programas de nóminas envían las cotizaciones a la Seguridad Social?
Preparan los ficheros, pero el envío sigue pasando por el Sistema RED con SILTRA. Holded, por ejemplo, genera el fichero CRA listo para importar en SILTRA. Pregunta a cada editor quién hace ese último paso: tú, tu gestoría o un profesional autorizado.
¿Qué pasa si una nómina sale mal calculada?
La empresa responde ante el trabajador y ante la Seguridad Social, aunque el error venga del programa. Lo habitual es corregirlo con una nómina complementaria y regularizar las cotizaciones. Por eso conviene hacer el primer mes en paralelo con la gestoría.
¿Cuánto cuesta PayFit en España?
El plan Estándar cuesta 16 € por empleado al mes, el Avanzado 19 € y el Premium 22 €, más una cuota base fija: 49 € de 1 a 3 empleados, 59 € de 4 a 9 y 69 € de 10 a 24. Cada centro de trabajo adicional suma 29 €. Todos los precios son sin IVA.
¿Cuándo es mejor cambiar de programa de nóminas?
A principio de año. Los acumulados de IRPF y cotizaciones empiezan de cero, y el certificado de retenciones del año sale de un solo programa. A mitad de año también se puede, pero hay que cargar los acumulados de cada empleado desde enero.